| Étrabonne, Besançon |
| Éternoz, Besançon |
| Épeugney, Besançon |
| Émagny, Besançon |
| École-Valentin, Besançon |
| Échevannes, Besançon |
| Échay, Besançon |
| Flagey-Rigney, Besançon |
| Flagey, Besançon |
| Fertans, Besançon |
| Ferrières-les-Bois, Besançon |
| Esnans, Besançon |
| Déservillers, Besançon |
| Durnes, Besançon |
| Devecey, Besançon |
| Deluz, Besançon |
| Dannemarie-sur-Crète, Besançon |
| Dammartin-les-Templiers, Besançon |
| Côtebrune, Besançon |
| Cussey-sur-l'Ognon, Besançon |
| Cussey-sur-Lison, Besançon |
| Cuse-et-Adrisans, Besançon |
| Cusance, Besançon |
| Cubry, Besançon |
| Cubrial, Besançon |
| Crouzet-Migette, Besançon |
| Courchapon, Besançon |
| Courcelles, Besançon |
| Corcondray, Besançon |
| Corcelles-Ferrières, Besançon |